برنامه ChemDoodle دارای امکانات بسیار متنوعی میباشد که به اختصار به موارد ذیل میتوان اشاره کرد:
1. برنامه ای برای ترسیم ساختار شیمیایی مواد بخصوص ترکیبات آلی به کمک ابزار مناسب و متنوع از جمله 24 نوع پیوند، اربیتالها، کربن نانوتیوبها، استرئو شیمی و مشخص کردن نام آیوپاک ساختار رسم شده.
2. ابزارهای قدرتمند برای نوشتن واکنشهای شیمیایی با انواع فلش ها برای نشان دادن واکنش به همراه قابلیت خواندن واکنشهای نوشته شده در فرمت RXN و RD .
3. این برنامه قابلیت خواندن طیفهای اسپکروسکوپی جرمی، NMR، IR با فرمت JCAMP-DX را دارد. شما میتوانید طیف NMR یا طیف جرمی ساختاری که رسم کرده اید را ایجاد کنید.
4. توانایی ایجاد ساختار سه بعدی ترکیب شیمیایی ترسیم شده.
این برنامه بصورت کرک شده میباشد و آخرین نسخه ارائه شده از این نرم افزار است.